1、臭氧對人體呼吸道粘膜有刺激，空氣中臭氧濃度達0.15ppm時，即可嗅出；按照國際標準，達0.5-1ppm時可引起口干等不適；達1-4ppm時可引起咳嗽；達4-10ppm時可引起強烈咳嗽。故消毒用臭氧消毒空氣，必須是在人不在的條件下，消毒后至少過30分鐘才能進入。

2、臭氧為強氧化劑，對多種物品有損壞，濃度越高對物品損壞越重，可使銅片出現綠色銹斑、橡膠老化，變色，彈性減低，以致變脆、斷裂，使織物漂白褪色等。已有數據表明，在不超過公眾衛生標準的濃度（＜0．1ppm）下，臭氧消除室內空氣污染的可能性很小。進入家庭的那些臭氧發生器，臭氧產生量大都難以控制，由于不同家庭的房間大小、通風狀況、室內物品多少都相差很大，使室內臭氧濃度難于穩定在安全標準下。造成這樣一種局面：濃度低于安全標準時，沒有消毒作用；濃度高于安全標準時，有了消毒作用，對人又產生傷害。家庭用戶又常常缺乏有關知識，這就更增加了使用上的麻煩，要么無效運行，要么有害人體健康，真是花錢買煩惱了。

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在使用臭氧消毒空氣時，最好在沒有人的情況下進行。

建議用臭氧消毒空氣時，一定在居室沒有人的情況下進行。市場上有些臭氧消毒器缺乏濃度控制和人員不在場才能消毒空氣的明確規定，就造成一種狀態，在有人的情況下開啟臭氧發生器，若對人沒有危害，則絕對沒有消毒作用；若有消毒作用則對人體肯定會造成傷害，濃度過高，人身處其間時間長了還會造成不可逆的人體傷害，要引起人們的高度警惕。

產生上述問題的癥結，就是對臭氧消毒器缺乏科學常識造成。專家主張，應該把一家一戶使用臭氧消毒器改為集中使用。即應使用大型的安全可靠的臭氧發生器，由接受過專門培訓的人員操作。在餐廳、學校、住宅樓等大的場所使用。